Fedora25 for workstationにMACS2を入れるまで
lpmなどが使いたかったので、gccが古いCentOS6を捨てて、CentOS7に目もくれず、なぜかFedora25を使い始めた。
モダン、かつ人柱感がすごい。。。
あと、ASRockのX58 extreme 3は、
たぶん、SSDやUSBメモリからはOSをブートできない。
BIOSをアップデートしても無理だった。
さて、lpmのインストールはとてもスムーズに終わったので、
調子に乗って色々とインストールしているのだが、
bedtools2.18などが入らない。。。
あと、MACS2がない。
pip install MACS2などとすると、
/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-cc1: No such file or directory
とくるのでここを参考に
sudo dnf install redhat-rpm-config
すると
pyconfig.h: No such file or directory
とくるので、ここを参考に
sudo yum install python-devel
sudo pip install MACS2
とすれば、大丈夫。本当はsudoを使いたくなかったけど。